verkeimtenの意味

ご指摘のとおり、引用いただいています文における verkeimten は、verkeimen という動詞の過去分詞 verkeimt が形容詞的に用いられたものとなっています。

verkeimen は、辞書にはなかなか載っていませんが、バクテリアやカビに汚染されることを言うようで、ネット検索ではある程度ヒットします。

Keim は、ご指摘のとおり、病原菌の意味があります。verkeimen の前綴り ver- には、vergolden （金メッキする）や verschleiern（ベールをかぶせる）などに見られる、「添加」を意味する機能に近いのではないかと思います。夏場にお茶がすぐに傷む・腐る、というのもバクテリアのせいですよね。他動詞ですので、sich verkeimen で用います。Das Wasser kann sich verkeimen. という具合です。名詞形の Verkeimung でもヒットします。

衛生面での文脈ですと、「腐る」「カビる」（Die Matratze kann sich verkeimen.）などになると思いますし、昨今の COVID-19 の文脈では「ウイルスに汚染される」のように、「汚染」という言葉が合いやすいかと思います。verkeimen で「感染」の意味はないと思います。感染というより「汚染」のほうが近いのではないでしょうか。

辞書に載りきらない語も少なからずあるのだと思います。

Verkeimung（verkeimen）ですが、あくまでも Keim ですので、「ウイルスや病原菌が付着した」＝「病原菌に汚染された」、という意味です。病原菌以外の汚染（たとえば放射性物質の汚染や海洋汚染; Verschmutzung）などには使わないと思います。よろしくお願いいたします。